Из 50 национальных парков Индонезии 6 являются объектами Всемирного наследия, 6 - биосферными заповедниками и 3 - водно-болотными угодьями международного значения по Рамсарской конвенции. Первая группа, состоящая из 5 парков, была провозглашена в 1980 г. Их число постоянно росло и достигло 41 к 2003 г. В 2004 г. были сознаны 9 новых парков, тем самым их число возросло до 50.
Гунунг-Палунг (индон. Taman Nasional Gunung Palung) - национальный парк в Индонезии, на острове Калимантан. Расположен в провинции Западный Калимантан, недалеко от города Кетапанг. Это один из немногих парков в мире, где орангутанов можно увидеть в дикой природе.
Данау-Сентарум (индон. Taman Nasional Danau Sentarum) - национальный парк в Индонезии, на острове Борнео. Расположен в провинции Западный Калимантан, в верхней части бассейна реки Капуас, примерно в 700 км от дельты. Включает в себя систему озёр и болот.
Кутай - национальный парк на восточном побережье острова Борнео. Расположен в индонезийской провинции Восточный Калимантан, к северу от реки Махакам в 120 км к северу от города Самаринда. Был создан в 1982 году. На территории Кутай находятся несколько населённых пунктов бугисов.
Лоренц (индон. Taman Nasional Lorentz) - национальный парк в индонезийской провинции Папуа. Является самой большой природоохранной территорией в Юго-Восточной Азии.Площадь парка составляет 25 056 км². Лоренц является выдающимся примером биологического разнообразия Новой Гвинеи.
Манусела (индон. Taman Nasional Manusela) - национальный парк в Индонезии, расположен на острове Серам. Парк включает прибрежные леса, лесные болота, низменности и горные леса. Наивысшая точка - гора Биная высотой 3027 метров. Площадь - 1890 км2.
Название Kepulauan Seribu (в переводе «Тысяча островов») вовсе не означает, что общее количество островов архипелага составляет тысячу. «Тысяча островов» - это название административного округа в городе Джакарта. Благодаря этому Джакарта является единственной столицей в мире,
Уджунг-Кулон (индон. Ujung Kulon) - национальный парк, расположенный в западной части острова Ява, в провинции Бантен, Индонезия. Включает в себя вулканическую группу островов Кракатау и некоторые другие острова в Зондском проливе.Площадь парка составляет 1206 км² (из них 443 км² заняты морем).
Национальный парк Келимуту, расположенный на территории острова Флорес (Flores) в Индонезии, официально начал свою работу в 1992 году. Известность парк приобрел благодаря цветным озерам, расположенным в кратере вулкана с одноименным названием. Высота вулкана составляет 1693 метра.
